据介绍，随着上海口岸出入境贸易额迅速增长，上海检验检疫局每年接受报检的业务量也直线上升。由于物理单证的流量巨大，所以对物理单证的管理存在着一定难度。而浦东局研发的“物理单证监控系统”可以通过条形码技术，给每张物理单证“发放”了惟一的“身份证”。这样一来，无论物理单证“走”到哪里，凭借条形码识别技术，浦东局的相关工作人员都能够通过“物理单证监控系统”对其进行监管，并完成电子报检数据和物理单证的核销工作，保证了对物理单证及其流转的监管。
如果说浦东局的“电子派单排队系统”是为条形码技术的应用作铺垫，那么“物理单证监控系统”则是充分发挥条形码技术的潜力。为了充分发挥条形码技术的作用，浦东局乃至整个上海局做了大量的基础工作。上海局通过探索研究，完成了条形码与报检信息的绑定设计，并建立了条形码和报检数据的关联库，将条形码输入与“电子派单排队系统”和“物理单证监控系统”连结起来，并为后续的开发应用打好了基础。
2004年下半年，以整顿报检窗口秩序，推行凭证报检为主要目的的“电子派单排队系统”在浦东上马。而浦东局则借此机会对条形码技术的应用进行了试点——通过“取号机”扫描物理单证上的条形码来智能识别业务类型，自动完成取号工作，并将“报检人排队号码”输入“电子派单排队系统”，最后将排队结果实时通知正在等候的报检人。此次试点的成功，使得条形码技术的准确性和快捷性得到了证明。
浦东局“物理单证监控系统”有效地保证了物理单证的交接畅通，而且还能防止物理单证的遗失。该系统具有监控性、实时性、简易性、先进性、联系性、完整性等特点。据介绍，自“物理单证监控系统”在2004年12月13日开始全面推广以来，浦东局的15个处室已装备扫描枪17把，所有物理单证的流转只需通过扫描即可完成。
在具体的应用中，浦东局各处室对“物理单证监控系统”表示满意。通过该系统的提示，该局已经杜绝了物理单证遗失情况的出现，并大幅度地提高了办公效率。浦东局综合业务处副处长杨海军表示：“通过对物理单证监控系统的开发应用，使我局实现CIQ2000电子单证与物理单证流程的有效衔接，做到对物理单证的有效监管，弥补CIQ2000流程管理中电子单证信息与物理单证流向不一致的问题。”